大半年的时间里，努尔哈赤专心一意的处理蒙古的问题——他既已感受到了林丹汗的雄图和野心，当然自己更要一步紧接一步的抢到先机，对付林丹汗。
另一方面则是蒙古喀尔喀扎鲁特部贝勒巴克在天命八年的正月到辽阳来朝见，双方的关系又有了进一步的发展。
早在多年前，喀尔喀的巴岳特部便已归附于后金，达尔汉贝勒的儿子恩格德尔娶了他的侄女巴岳特格格，做了他的“额驸”，成为后金的一员了；其他的三部：巴林、翁吉拉特和乌齐埒也都与巴岳特同心齐力，与后金结为盟邦，或索性归附，成为后金的子民，惟有札鲁特部，常常反覆无常的出些令他不快的状况。
原本札鲁特部便是喀尔喀五部中实力最强的一部，贝勒介赛也是个不凡的英主，曾经自恃兵强马壮，而与明朝交换条件般的立盟誓；喀尔喀五部在巴岳特部的主导下，遣使来共尊努尔哈赤为“昆都仑汗”时，他并没有明显的反对，甚至没有表示任何意见，也派了人来共同与会；但日后却有多次在暗中做怪，扯后腿。
最严重的一次是天命四年的七月，后金军攻取铁岭；介赛竟先接受了明朝的条件，协助明军作战——这支军队埋伏在城外的高粱地里，袭击后金军；而交锋的结果却是大败，介赛和二子、三婿、二弟及兵将二百多人都被俘虏。
当时，努尔哈赤在经过一番思考后，没有处死介赛，而仅是囚禁；两年后，札鲁特部遣使来谈条件，愿以牲畜万头赎回介赛，并以二子一女为质，保证札鲁特部此后与后金结盟为友好，绝不为敌。
这当然是双方关系的最好的转变——努尔哈赤立刻就答应了，于是与介赛盟誓，又命诸贝勒送介赛返回，并以所质之女嫁给代善为妻。
冤家变成亲家了，而后，他派人与五部会盟，札鲁特部的表现也非常好——而今，巴克贝勒亲来朝见，当然又把双方的关系拉近得更密切了。
他自然要将这次的朝见视为大事。
关于科尔沁部，则又是另一种的处理方式。
皇太极的“请期”之举，圆满达成，双方约定在两年后举行婚礼；但，他也得到了确实的消息：“林丹汗对于科尔沁部交好后金大为不满，已将科尔沁部列为第一个要攻伐的对象——甚且扬言，将在结冰、草枯以前，夹击科尔沁部！”
消息并不令他感到意外——其实早在他的意料之中——他也早已开始准备这迟早都要发生的战争了。
而相对于关于明朝的情形，他没有采取具体的行动，但也没有放过任何一个可靠的消息。
明朝连续任命了两名总兵官，也都赐给了尚方宝剑——正月里，由孙承宗所推荐的马世龙出任辽东总兵，二月里又赐了平辽总兵毛文龙尚方宝剑。
这当然表示，明朝对辽东的问题十分重视——而他也胸有成竹的想妥了应对之策：“孙承宗固然是能人，但，能在辽东待多久呢？”他一本对付熊廷弼的方法——避免直接对垒，等待明朝自己罢废这些能人之后再出兵——这是不费一兵一卒的上上之策，而且，已经得到过成功的经验了，他对自己所订的对策非常有把握。
孙承宗其实早在出任兵部尚书、东阁大学士之初就已经开始得罪朝廷里的大臣了。
第一个原因在于他是个有见识的人，看得清问题的重心，于是一上任就上疏指出，目前的国防问题，基本上是在于“兵多不练，饷多不核”，所以，军队的作战能力差；而且，在制度上也有亟待改进的缺失：“以将用兵，而以文官招练。以将临阵，而以文官指发。以武略备边，而日增置文官于幕。以边任经、抚，而日问战守于朝。此极弊也。”
而这些话固然说得一针见血，却影响到了许多人的利益。
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