杨涟只休息了一天，服了几帖药，自己觉得精神体力都恢复了，第二天就取消了告假，回到朝班去。
他的心中有一股勃发之气在支持着他，使他的生命力变得超乎常人的健旺，很轻易的战胜了病魔；而紧接着，喜事也来了——他的官职升迁为兵科都给事中。
这是拥立新君的“功臣”中第一个升官的，他连连谦称不敢当，再三推辞，但毕竟诏命已出，哪有因他的谦辞就收回的呢？三辞之后，他便改成了叩首谢恩，庄严肃穆的接受了新职。
左光斗第一个来向他道贺，寒暄、致了贺意之后，左光斗立刻语重心长的向他说出内心深处的期盼：“年兄这番高升，是开了一个大好的头；接下来，新朝新政，还将陆续有一番人事上的变动——时机大好，我辈东林中人，好好的掌握住这波变动的机会，则又将有一番大作为了！”
杨涟对这话极有同感，立刻回应——他先是谦称了一句：“愚弟其实是‘抛砖引玉’啊！”
接着立刻畅言：“自叶阁老去职，东林之人久难左右政局，现在，果然有机会了！”
方从哲的无能早已令人不满，虽然在这次的拥立新主的事情上一反乡愿常态的出了许多力，但是，“形势比人强”，新君登极后展开新政，势必要撤换内阁首辅了。
继位者如系东林中人，甚或叶向高重新入阁，那么，“东林执政”的时代将要到来了；而能影响内阁首辅的人选的，目前，居第一份量的人就是杨涟！
杨涟虽因年轻、资历不足，自己还未达入阁的资格，但以“红丸”、“移宫”两案之后，声名大噪，天下皆知，成为朝中名臣——左光斗犹且分析：“先帝曾特召年兄进宫面圣，是有‘顾命’之实，于今上又为拥立第一功臣——如今，年兄在万岁爷跟前说话的份量早已经超过了内阁首辅——”
他甚至断言，杨涟这次的升迁，只是“先期”之举，接下来，势必还会有“连升三级”的情形；而杨涟在朝中的份量越重，对东林就越有利！
美好的希望，光明的远景，都已经来到眼前了！
于是，两人索性仔细的计划了起来，逐一的细数“应该”出任要职的东林人士：叶向高、邹元标、赵南星、高攀龙——也开始遥想着，当这些正人君子们执掌大权之后，将如何的推动着政治改革，使已处在衰败状态的大明王朝得到新生——
而在内阁首辅的人事发生异动前，辽东的人事有如首当其冲般的率先发生了异动，而且目标集中——异动的其实只有一个人，那就是熊廷弼。
熊廷弼原本与东林有隙，双方的恩怨早在万历三十九年就结下了。
那年，熊廷弼任南直隶提学御史；江南向为文风鼎盛之地，文士最受礼遇，但也因地方过度重视文士而形成强悍的士风，受学的生员成为天之骄子，常以些微小事群起抗争，或包围官府，或焚烧缙绅房屋，不时有案例呈报朝廷；熊廷弼在上任之前，已对这种恶风有所耳闻，苦思改善之道，上任之后，采取他在辽东任官时的一贯的雷厉风行的方式压制江南文士，虽然减少了生员抗争的事情，却导致了多人的怨恨。
接着，他大力改革江南教育变迁的种种流弊，结果是结下了更多的仇怨。
原来，依制，提学官三年一任，任内要举行两种考试，一种是岁考，另一种是科考；岁考以六等试诸生优劣，科考亦按成绩的优劣分为六等，第一、二等受赏，取得参加乡试的资格，称为科举生员，置于末等者，则丧失参加乡试的资格，无疑与功名绝缘了；因此，全国的读书人既因前途操在“考试成绩”中，读书的目的也就是为了考试，所读的书竟全系应试的八股范文；心怀理想的熊廷弼当然不认同这种世俗流弊，大力改革，以矫文风，每试必要求士子书写经论四篇，未交者不予列入一、二等；这么一来，又断送了许多人的前途。
而且，他为矫弊，打击地方恶势力，在任上大力提拔寒微之士，黜退乡绅津要子弟，尤其以东林子弟为多。
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